Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
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Usp48Q3V0C5 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
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Usp48Q3V0C5 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
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Usp48Q3V0C5 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Usp48Q3V0C5 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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