Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 AC158603.2-201ENSMUST00000219191 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC154528.1-201ENSMUST00000228584 527 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 4930428N03Rik-201ENSMUST00000038250 986 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Melk-201ENSMUST00000045607 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Hrh4-201ENSMUST00000041676 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Rnf214-209ENSMUST00000161203 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Slc2a12-201ENSMUST00000042261 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Rad54b-201ENSMUST00000070755 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Gm45515-201ENSMUST00000210796 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Hsp90ab1-201ENSMUST00000024739 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Ndrg3-203ENSMUST00000109558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ppil4-201ENSMUST00000015901 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Hcfc1r1-202ENSMUST00000179928 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Gm28233-201ENSMUST00000189360 356 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Rnu3b3-202ENSMUST00000198628 215 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Rnu3b4-202ENSMUST00000199460 216 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Rnu3b1-202ENSMUST00000200547 215 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm7836-201ENSMUST00000209730 432 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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