Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms