Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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RxraP28700 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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RxraP28700 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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RxraP28700 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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