Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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H2-Eb1P04230 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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H2-Eb1P04230 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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