Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Tmf1B9EKI3 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Tmf1B9EKI3 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Tmf1B9EKI3 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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