Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Ighv14-2-201ENSMUST00000103467 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Atp5k-202ENSMUST00000118632 272 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15464-201ENSMUST00000118718 431 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 n-R5s43-201ENSMUST00000122739 110 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm13546-202ENSMUST00000138444 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Mir124-2hg-205ENSMUST00000189467 173 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gabra4-203ENSMUST00000198138 440 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC211878.7-201ENSMUST00000222851 661 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Atp5k-201ENSMUST00000049628 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Tas2r138-201ENSMUST00000076565 996 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Cldn34b1-201ENSMUST00000096852 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm28250-201ENSMUST00000187025 2168 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37157-201ENSMUST00000192120 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37112-201ENSMUST00000194389 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm6348-201ENSMUST00000200751 1443 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Gm6346-201ENSMUST00000201146 1443 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Itgb1bp2-201ENSMUST00000033674 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14188-201ENSMUST00000105060 168 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Sat2-202ENSMUST00000108656 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14813-201ENSMUST00000122291 395 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm12989-201ENSMUST00000122331 731 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm11953-201ENSMUST00000122352 1003 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
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