Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms