Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 9130214F15Rik-201ENSMUST00000208727 1653 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Btg1-201ENSMUST00000038377 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 H6pd-202ENSMUST00000084117 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Clcn7-201ENSMUST00000040729 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm37314-201ENSMUST00000193545 2685 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprtQ99M80 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprtQ99M80 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprtQ99M80 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprtQ99M80 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gsap-201ENSMUST00000036031 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprtQ99M80 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Klhl20-201ENSMUST00000111611 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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