Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms