Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm23021-201ENSMUST00000158765 169 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC157570.2-201ENSMUST00000219091 700 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm7695-201ENSMUST00000220900 641 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Elavl2-203ENSMUST00000107109 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Elavl2-205ENSMUST00000107111 1552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC153821.1-203ENSMUST00000218105 607 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC165157.2-201ENSMUST00000222265 367 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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