Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Srp54b-201ENSMUST00000164243 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Mir501-201ENSMUST00000102296 109 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15738-205ENSMUST00000210378 1051 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18641-201ENSMUST00000211763 1246 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Try4-201ENSMUST00000031913 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Prpmp5-201ENSMUST00000048686 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ucn2-201ENSMUST00000052724 1155 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19683-201ENSMUST00000209748 1781 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Hhex-202ENSMUST00000128184 1435 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Arl6-201ENSMUST00000023405 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Pnpla7-201ENSMUST00000045295 4574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tex48-202ENSMUST00000102862 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16310-201ENSMUST00000124376 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12364-201ENSMUST00000144419 547 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13944-202ENSMUST00000146495 542 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9621-201ENSMUST00000183322 1003 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44790-201ENSMUST00000204137 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7936-201ENSMUST00000069529 375 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Lpin3-203ENSMUST00000109456 3470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6351-203ENSMUST00000139828 1542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp873-204ENSMUST00000210325 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms