Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms