Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Btnl5-ps-202ENSMUST00000173333 461 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm20529-201ENSMUST00000173683 203 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm19402-201ENSMUST00000180297 801 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm27435-201ENSMUST00000183588 88 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm35501-202ENSMUST00000215101 459 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Cinp-205ENSMUST00000221182 774 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC101831.1-201ENSMUST00000228245 691 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Btg1-ps2-201ENSMUST00000089060 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm16026-201ENSMUST00000094774 580 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC123665.5-201ENSMUST00000226648 1392 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC132467.1-201ENSMUST00000226498 1845 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm15283-201ENSMUST00000125308 1451 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Mtfr1-203ENSMUST00000119865 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm11756-201ENSMUST00000107310 1312 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms