Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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