Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc180J3QNE4 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc180J3QNE4 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc180J3QNE4 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc180J3QNE4 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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