Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms