Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmf1B9EKI3 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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