Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm24542-201ENSMUST00000103870 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Nxpe1-ps-202ENSMUST00000210160 956 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC124465.1-201ENSMUST00000222349 746 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 4933417G07Rik-201ENSMUST00000199681 1137 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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