Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Mill2-205ENSMUST00000227379 1998 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Ceacam1-202ENSMUST00000098668 1478 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps3-201ENSMUST00000104925 468 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Arpc3-204ENSMUST00000111716 838 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm12421-201ENSMUST00000119071 307 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15873-201ENSMUST00000123390 761 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm17139-201ENSMUST00000163802 571 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm8857-201ENSMUST00000170064 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Uchl1os-202ENSMUST00000177319 505 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Gm7577-201ENSMUST00000182543 982 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 1700012B07Rik-201ENSMUST00000020941 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm45323-201ENSMUST00000209853 413 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Gm10335-201ENSMUST00000096020 468 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Gm10132-201ENSMUST00000099431 468 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm18639-201ENSMUST00000210442 1769 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Naa20-204ENSMUST00000134759 1883 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d24-208ENSMUST00000201089 4081 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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