Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn23Q9D7D7 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Cldn23Q9D7D7 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms