Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Lrif1Q8CDD9 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Lrif1Q8CDD9 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Lrif1Q8CDD9 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Lrif1Q8CDD9 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Lrif1Q8CDD9 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Lrif1Q8CDD9 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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