Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Tpd52l2-201ENSMUST00000000844 2950 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Zbbx-202ENSMUST00000107775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Pilra-201ENSMUST00000058897 2578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Mlip-210ENSMUST00000184322 2668 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 AC132392.1-202ENSMUST00000216652 2681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm15368-201ENSMUST00000120438 858 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Vmn1r221-201ENSMUST00000122275 1084 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm23833-201ENSMUST00000158900 252 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm36976-201ENSMUST00000192632 1110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm34727-201ENSMUST00000195175 529 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm43246-201ENSMUST00000197597 564 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm43139-201ENSMUST00000199914 284 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm44778-201ENSMUST00000206447 668 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm33882-201ENSMUST00000208990 651 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm7979-201ENSMUST00000223009 1025 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 AC158531.1-201ENSMUST00000224617 457 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Rarres2-201ENSMUST00000009425 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Ints10-204ENSMUST00000110242 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Zfp655-202ENSMUST00000167316 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Mmp19-201ENSMUST00000026411 3402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Rfx3-208ENSMUST00000174850 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Phc1-201ENSMUST00000079560 3839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Acsl6-206ENSMUST00000101211 3106 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Apex2-204ENSMUST00000112721 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Atp5g1-204ENSMUST00000178611 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Zfp354b-203ENSMUST00000164280 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Uspl1-204ENSMUST00000119685 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Klhl15-209ENSMUST00000170594 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Pnpla7-201ENSMUST00000045295 4574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm22369-201ENSMUST00000102415 104 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Ighv1-55-201ENSMUST00000103526 415 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm9599-201ENSMUST00000117473 481 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Rpl7l1-ps1-201ENSMUST00000118822 725 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm12109-201ENSMUST00000121140 697 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm14514-201ENSMUST00000121680 940 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm11635-202ENSMUST00000139424 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm17304-201ENSMUST00000167618 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Pax4-205ENSMUST00000174194 974 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Ngf-204ENSMUST00000198644 1120 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm7397-201ENSMUST00000208298 361 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Olfr925-ps1-201ENSMUST00000217295 780 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms