Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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