Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms