Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Olfr17-201ENSMUST00000098138 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Slc16a4-202ENSMUST00000106723 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms