Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pramef12-201ENSMUST00000030326 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 CT033781.3-201ENSMUST00000221886 504 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms