Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Igkv14-130-201ENSMUST00000103307 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm6375-201ENSMUST00000205201 1145 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 AC122354.1-201ENSMUST00000222328 702 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Olfr1418-201ENSMUST00000079875 1072 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20795J3QP49 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms