Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms