Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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