Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm5407-201ENSMUST00000080694 747 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms