Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
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