Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm4279-201ENSMUST00000154314 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ppp6c-201ENSMUST00000028087 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Wdr48-205ENSMUST00000215307 3776 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Rbm25-201ENSMUST00000048155 4226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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PtprtQ99M80 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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PtprtQ99M80 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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PtprtQ99M80 Wdr48-208ENSMUST00000217472 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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PtprtQ99M80 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm44280-201ENSMUST00000204498 3111 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Nt5dc1-201ENSMUST00000047885 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Zfp638-201ENSMUST00000032088 6199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ccdc171-201ENSMUST00000053414 4525 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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PtprtQ99M80 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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PtprtQ99M80 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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PtprtQ99M80 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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PtprtQ99M80 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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PtprtQ99M80 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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PtprtQ99M80 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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PtprtQ99M80 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Napg-201ENSMUST00000025474 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Abca8a-201ENSMUST00000046223 5614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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