Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Il1bos-202ENSMUST00000156601 2425 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Eps15l1-205ENSMUST00000212590 3376 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Muc2-201ENSMUST00000026590 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm16701-201ENSMUST00000181309 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Cherp-201ENSMUST00000079510 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 AC192334.3-201ENSMUST00000221828 569 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Ensa-201ENSMUST00000037983 3845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Ocm-202ENSMUST00000085704 330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 AC153862.1-201ENSMUST00000215700 3349 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm23835-201ENSMUST00000104439 132 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp48Q3V0C5 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms