Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms