Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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