Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

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Length 1,482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Grin2bQ01097 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Grin2bQ01097 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Grin2bQ01097 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms