Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RxraP28700 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
RxraP28700 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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