Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P20040 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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P20040 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P20040 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
P20040 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
P20040 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
P20040 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
P20040 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
P20040 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
P20040 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
P20040 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
P20040 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
P20040 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
P20040 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
P20040 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
P20040 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
P20040 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
P20040 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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