Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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H2-Eb1P04230 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms