Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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