Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Use1Q9CQ56 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms