Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Card11Q8CIS0 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Card11Q8CIS0 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Card11Q8CIS0 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Card11Q8CIS0 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Card11Q8CIS0 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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Card11Q8CIS0 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Card11Q8CIS0 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.8 ms