Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms