Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 4933404K13Rik-203ENSMUST00000217125 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC165159.2-201ENSMUST00000224080 441 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Tnp1-201ENSMUST00000027374 437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Endov-201ENSMUST00000064513 954 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Snora43-201ENSMUST00000082924 127 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Defa32-201ENSMUST00000084041 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Defa20-201ENSMUST00000084042 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm5121-201ENSMUST00000085711 627 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Uba3-202ENSMUST00000164744 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Smok3b-201ENSMUST00000100537 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Sstr2-202ENSMUST00000106630 1537 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Zfp715-203ENSMUST00000107986 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm26748-201ENSMUST00000180406 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Sec31a-210ENSMUST00000182886 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Serpina1c-201ENSMUST00000074051 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Slc4a11-201ENSMUST00000099362 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Runx1-207ENSMUST00000189679 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Rps25-204ENSMUST00000216076 393 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC157772.1-201ENSMUST00000226266 365 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Ucma-201ENSMUST00000027978 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms