Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms