Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Grin2bQ01097 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Grin2bQ01097 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Grin2bQ01097 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Grin2bQ01097 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Grin2bQ01097 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Grin2bQ01097 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Grin2bQ01097 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Grin2bQ01097 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2bQ01097 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms