Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm15128-201ENSMUST00000112814 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Ankrd55-201ENSMUST00000022275 2412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Otoa-201ENSMUST00000047025 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Rcbtb2-209ENSMUST00000164822 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 CT025642.3-201ENSMUST00000225503 4086 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd1P40201 G3bp2-201ENSMUST00000113127 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Nek6-201ENSMUST00000054234 10338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Slco1b2-204ENSMUST00000203597 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Ablim1-203ENSMUST00000104902 5907 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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