Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms