Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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